土壤污染防治学科始建于1978年，经过近四十年不断发展与完善，已成为生态环境部科技创新体系建设的重要学科之一。2008年建立“国家环境保护土壤环境管理与污染控制重点实验室”。2011年成立土壤污染防治研究中心，其主要职责是：针对我国土壤环境问题，瞄准国家环境战略需求和国际土壤环境科学发展前沿，以改善土壤环境质量和保障土壤环境安全为核心，开展土壤环境管理与污染控制相关的前瞻性和战略性的理论与应用技术研究。

目前共有土壤环境基准与标准、区域土壤环境安全、污染地块风险管控与修复、土壤与地下水污染防治、企业用地土壤环境管理5个学科方向。

中心拥有国内顶尖的专业研究团队，其中生态环境部创新体系土壤污染防治学科首席专家、高等法院环境资源审判咨询专家、享受国务院政府特殊津贴1人，生态环境保护青年拔尖人才3名，江苏省“333”人才1名。2021年土壤中心总人数70人，正式在岗在册52人，退休返聘1人，长期项目聘任27人。其中研究员6人，副研究员13人，高级工程师2人。博士37人，硕士31人。专业结构全面合理，主要包括：土壤学、环境科学、环境工程、化学、生物学、生态学、水文学、地质学、大气环境、地理学、环境模拟、大地测量、农业资源利用等。

近年来，中心参与研究制定多项土壤政策法规、标准规范，包括土壤环境质量标准、场地环境保护系列标准等；业务范围包括：污染场地调查评估与修复、污染农田调查评估与修复、地下水污染防治、在产企业地块污染防治、土壤环境信息技术、修复材料与设备研发等；主持/参与各类科研项目多项，包括国家重点研发、“973”、“863”、科研支撑、自然基金、重点研发计划、环保公益科研专项以及其他省部委环保科研项目等。获省部级及其他科技奖项20余项，发表文章140余篇，国家专利60余项。