研究生教育是整个教育链的最高端，旨在教育强国。生态环境部南京环境科学研究所在学位管理、规模和结构、学科建设等方面加强调控，提高研究生教育的质量。南京环境科学研究所招收攻读硕士学位研究生，是为了培养热爱祖国，拥护中国共产党的领导，拥护社会主义制度，遵纪守法，品德良好，为社会主义建设服务，掌握本学科坚实的基础理论和系统的专业知识，具有创新精神和从事科学研究、教学、管理或独立担负专门技术工作能力的高级专门人才。