各有关单位:
根据“生态环境部南京环境科学研究所委托业务管理规定”有关要求,生态环境部南京环境科学研究所(以下简称“南京所”)现组织开展水体污染物环境效应评估项目全基因组甲基化测序委外业务采购申报。请有意向的单位按照下列相关要求组织申报:
一、供应商的资格要求
1. 在中华人民共和国境内注册,具有独立法人资格的企事业单位,有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录,本次公开征集不接受个人申请及单位联合申报或项目分包。
2. 申请单位信用管理良好,过去三年无不良记录。
3. 申请单位必须拥有(自有)运行良好的专业测序设备以满足三代测序要求,其中通量高、数据产出量大的仪器优先考虑;同时参与该项目的试验人员和信息分析人员,均应具有相应的专业教育学历、专业技术知识培训以及较丰富的业务工作经验,提供相关学历或发表文章等文件复印件。发表过CNS(cell,nature,science)或者影响因子不低于nature genetics水平的SCI文章则可优先考虑。(注:须提供包含投标人单位人员参与发表文章的首页并盖章。)
4. 申请单位需提供质量管理体系认证、职业健康安全管理体系认证、环境管理体系认证相关材料。
二、采购内容及预算
1、采购需求:水体污染物环境效应评估项目全基因组甲基化测序。
2、采购预算:7万元(人民币)
3、服务时间:合同约定。
4、付款比例:以实际产生的测序费用为准。
申报单位于2020年12月31日前提交申报书及其附件(盖章原件一式五份,密封袋装后邮寄给本bt365最新网址_必发365一些奖金_365亚洲体育平台中联系人),营业执照等相关材料复印件,逾期不予受理。南京所将根据相关规定,按照“公平、公正、公开”的原则组织评审,择优确定项目承担单位。测序内容及样品数量要求详见下表1。
表1 本项目内容及样品数量
序号
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内容
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样品数量
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1
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全基因组甲基化测序
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15
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2
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测序数据分析:
(1)测序数据质量评估及统计:测序质量值分布统计;测序数据产出统计;
(2) 与参考基因组比对分析;
(3) 全基因组内甲基化位点鉴定和深度统计;
(4) 甲基化5mC和6mA位点的比例统计;
(5) 全基因组甲基化位点区域分布;
(6) 不同类型5mC和6mA的甲基化水平分析;
(7) 全基因组内DNA甲基化图谱绘制;
(8) 不同基因功能区域内的甲基化水平统计;
(9) repeat区域及上下游的甲基化水平分布;
(10) CpG岛区域及上下游的甲基化水平分布;
(11) 5mC位点序列特征分析,6mA 位点motif分析;
(12) 样品间相关性分析;
(13) 聚类分析;
(14) PCA分析;
(15) 样品间差异甲基化位点分析;
(16) 差异甲基化位点注释基因的GO注释,KEGG注释,富集分析等;
(17) 样品间差异甲基化区域分析:差异甲基化区域关联基因的GO注释,KEGG注释,富集分析等
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三、投标截止时间及投标邮寄地址
1、投标截止时间:2020年12月31日下午17时整。
2、投标邮递地址:生态环境部南京环境科学研究所(江苏省南京市蒋王庙街8号)。
3、投标文件一式五份,密封装袋后邮寄给本bt365最新网址_必发365一些奖金_365亚洲体育平台中联系人,否则作为不符合投标要求文件处理。
4、本次投标结果直接在本所网站上bt365最新网址_必发365一些奖金_365亚洲体育平台,不再直接通知投标单位评审结果,投标单位自行查询。
四、联系方式
采购人:生态环境部南京环境科学研究所
联 系 人:张静
联系电话:025-85287093
地 址:生态环境部南京环境科学研究所(江苏省南京市蒋王庙街8号)
附件1_申报指南.doc
附件2_申请函.doc
附件3_申报书.doc
生态环境部南京环境科学研究所
2020年12月24日